За време рата Јапан је био савезник нацистичке Немачке и није одустао од планова да ратује против СССР-а, упркос споразуму о узајамној неутралности склопљеном у априлу 1941. године у Москви. Током рата јапанска страна је више пута смишљено кршила споразуме.
Владајући кругови и специјалне службе Јапана велике наде су полагали у примену бактериолошког оружја. Оно је посматрано као средство које може да одигра готово одлучујућу улогу у борби против непријатеља.
На изради и тестирању оваквог оружја радили су 731. и 100. специјални одред Квантушке армије. Људе су инфицирали изазивачима куге, антракса, колере, тифуса и другим микробима, услед чега је већина њих умрла у мукама, док су преживели били изложени даљим експериментима, а затим убијани. Као жртве јапанских милитариста страдале су хиљаде људи, преносе руски медији.
Према документима са којих је скинута ознака поверљивости, Јапан је планирао да бактериолошки рат започне у јуну 1945. Јапан је капитулирао у августу исте године.